本发明涉及一种微型化的甲醇自热重整制氢集成装置和制氢方法。该氢源技术的特征为集成有甲醇自热重整和CO选择氧化(PROX)等主要反应单元，无需传统的CO水气变换单元，且仅用两级CO选择氧化；该氢源集成系统包括一组甲醇自热重整/换热模块、一组催化燃烧/ 汽化模块，两组CO选择氧化/换热模块，四组模块均为整体式催化反应器与微通道换热器焊接集成方式。利用本发明可获得CO浓度小于30 ppm、H ₂浓度大于53％的1kW级重整气(干气)。